Opciones que existen:
1.- Winzip: puedes encriptar todo el contenido de un zip, de esa forma la información estara mas o menos segura, digo mas o menos porque dependiendo de la clave escogida se podra hackear.
2.- Winrar: igual al anterior
3.- Programas que permiten encriptar el contenido de una carpeta, sin comprimirla, ejemplos:
Lock Folder:
http://www.newsoftwares.net/folderlock/spanish/
Hide My Files 1.0.31: http://www.freedownloadmanager.org/es/downloads/Hide_My_Files_20916_p/